Технология (UNIST) в Южной Корее представила свою новую диагностическую технику, известную как флуоресценцию in situ Гибридизация (FISH), используя искусственные полимеры — пептидную нуклеиновую кислоту (PNA) — которые действуют как зонды, чтобы связываться с различными генетическими последовательностями в бактериях. Когда две молекулы зонда связываются с мишенью, излучаются флуоресцентные сигналы, которые по существу выявляют отпечаток пальца разных патогенных микроорганизмов.
«флуоресценция in situ Метод гибридизации (FISH) позволяет быстро обнаружить и идентифицировать микробы на основе их различия в геномной последовательности без трудоемкого культивирования или секвенирования,-отметили ученые. »Однако недавний взрыв микробных геномных данных сделал сложным для разработки подходящего набора зондов для микробных смесей. Мы разработали новый набор зондов рыбы на основе пептидной нуклеиновой кислоты (PNA) с оптимальной специфичностью-мишенью путем анализа изменений в последовательности рибосомной РНК 16S по всем видам бактерий ».
Schematic representation illustrating how FISH worksUNIST
In the lab, FISH Обнаружены семь видов бактерий, которые обычно заражают людей — klebsiella pneumoniae , proteus mirabilis, bacillus subtilis , Enterococcus faecalis , escherichia coli , pseudoNis, escherichia coli , , , , escherichia coli , , , escherichia coli , , , escherichia coli , , , escherichia coli , pseud staphylococcus aureus . Это оказалось более чем на 99% точным для всех, кроме s. aureus — Патоген, который заражает кожную ткань, которая имела все еще высокий уровень успеха 96,3%. Некоторые обнаружения были до 99,9%. «Быстрая идентификация последовательных видов была реализована с использованием химически расщепленных флуорофоров, без ущерба для точности обнаружения. Из -за их выдающейся точности и повышенной скорости этот набор методов показывает большой потенциал для клинического использования».Хотя это может показаться (вроде) просто, эффективность системы противоречит работе, которая вошла для ее разработки. Команда проанализировала 19 885 известных генетических последовательностей из 14 614 видов бактерий, затем разработала видоспецифичные последовательности PNA для нацеливания на рибосомальную РНК жука. ПНА -зонды имеют четкие преимущества по сравнению с традиционными зондами ДНК и могут проходить через клеточные стенки патогена. Наличие двух зондов с одним и тем же патогеном повышает точность, особенно в тех случаях, когда болезнь была вызвана несколькими патогенами. Обычные диагностические инструменты — анализы крови и анализы полимеразной цепной реакции (ПЦР) могут занять дни до недель. Для пациентов, сражающихся с критичными, опасными для жизни инфекциями, такими как сепсис, важно как можно скорее диагностировать и лечить.
Быстрый поворот с результатами может также помочь избежать введения пациентов неверных антибиотиков. в Unist.
Теперь команда проведет больше испытаний на образцы крови, взятые у больных пациентов, чтобы оценить, насколько хорошо рыба может работать в клинических условиях.
