Ученым впервые удалось извлечь молекулы РНК из вымершего вида. Эта веха была достигнута с тилацином, видом плотоядных сумчатых, который бродил по Австралии примерно сто лет назад – и однажды может снова появиться, если нынешние планы принесут плоды.
Когда-то тилацин, широко распространенный по всей Австралии, последние несколько тысячелетий своего существования провел изолированно на острове Тасмания. Там он оказался легкой добычей для первых европейских колонизаторов, которые считали его вредителем своих сельскохозяйственных угодий и систематически уничтожали их. Через несколько десятилетий траектория существа стала ясна, и меры государственной защиты в конечном итоге были приняты, но было слишком поздно, и последний известный экземпляр умер в неволе в 1936 году.
Учитывая недавность своего исчезновения (и, возможно, изрядную дозу вины), тилацин включен в короткий список видов, подлежащих «воскрешению». Генетическая компания Colossal Biosciences, наряду с мамонтом и дронтом, заявила о своем намерении воскресить тилацина с помощью методов генной инженерии.
С этой целью ученым удалось почти полностью реконструировать геном тилацина. Но эта схема ДНК на самом деле является лишь частью биологической головоломки: ученым также нужен ее «транскриптом» или схема РНК, которая подробно описывает, как гены экспрессируются и регулируются в различных тканях организма.
Ученые собрали РНК из 130-летний экземпляр тилацина из коллекции Шведского национального исторического музея Эмилио Мармола Санчеса и Панайотиса Калогеропулоса
Теперь ученые в Швеции сделали первый шаг к этой цели, извлекая РНК из образца тилацина, хранившегося в музейной коллекции в течение 130 лет. Это впервые произошло не только с тилацином, но и с любым вымершим видом, поскольку РНК имеет тенденцию очень быстро разлагаться вне живой клетки.
В новом исследовании ученые разработали новый метод извлечения древней РНК, адаптировав методы, обычно используемые для более поздних образцов. При этом им удалось извлечь и очистить сотни миллионов фрагментов РНК из кожи и мышечной ткани тилацина. После учета дубликатов и неприемлемо коротких последовательностей они получили 1,5 миллиона последовательностей мышечной РНК и 2,8 миллиона последовательностей кожной.
Анализ связал последовательности мышечной РНК с 236 генами, включая те, которые производят белки, такие как актин и титин. , которые отвечают за растяжение и сжатие. Образцы кожи соответствовали 270 генам, в том числе гену, который вырабатывает кератин — белок, образующий прочное покрытие кожи, волос и ногтей. Интересно, что команде даже удалось идентифицировать несколько фрагментов молекул РНК, которые, по-видимому, произошли от вирусов, обитавших в тилацине или на нем.
Это исследование помогает составить более полную картину тилацина, давая колоссальные данные. лучшая основа для оживления существа. Тем не менее, конечно, до этого еще довольно далеко, если вообще когда-либо. Между тем, новая работа предполагает, что другие музейные образцы могут скрывать полезные молекулы РНК, которые могут дать новую информацию.
Исследование было опубликовано в журнале Genome Research.
>
